堆肥：以各类桔秆、落叶、青草、动植物残体、人畜粪便为原料，微生物有机肥品牌，与少量泥土混合堆积而成的一种有机肥料。
沤肥：沤肥所用原料与堆肥基本相同，丽江微生物有机肥，只是在淹水条件下进行发酵而成。
厩肥：指猪、牛、马、羊、鸡、鸭等畜禽的粪尿与秸秆垫料堆沤制成的肥料。
沼气肥：在密封的沼气池中，微生物有机肥代理，有机物腐解产生沼气后的副产物，包括沼气液和残渣。
绿肥：利用栽培或也生的绿色植物体作肥料。如豆科的绿豆、蚕豆、草木樨、田菁、苜蓿、苕子等。非豆科绿肥有黑麦草、肥田萝卜、小葵子、满江红、水葫芦、水花生等。
生物有机肥设备所产产品是以鲜鸡、猪粪为原料，不含任何化学成份，而鸡、猪消化能力差，只能消耗掉25%的营养成份，而饲料中另外75%营养成分随粪便排出，从而使干成品含氮、磷、钾、有机质、氨基酸、蛋白质等成份。对堆肥产生的恶臭需加以防治与控制，避免二次污染。在堆料中加入发酵剂或快速分解菌可在较短时间内消减臭气，且感官效果较好;或者对堆肥场产生的恶臭气体以生物除臭技术等进行处理。
在生物有机肥的生产过程中需有效地控制影响有机废物发酵、微生物繁殖的各因素。主要的影响因素为有机质含量、含水率、碳氮比、堆肥过程的氧浓度和温度以及pH值等。一方面，微生物有机肥生产，通过对诸因素的控制满足各微生物菌的种的生长繁殖所必需的碳氮比、温度、湿度、pH值、氧量及其它的营养元素;另一方面，不同的营养物质含量可产生不同效果的肥效，比如含碳量高有助于土壤真菌增多，氮则有助于土壤细菌增多，而钙对于作物抗病有明显的效用。
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